Mycovirus merupakan virus yang menginfeksi jamur dan berpotensi memengaruhi karakter biologis inangnya, termasuk virulensi. Salah satu jamur yang dapat menjadi inang mycovirus adalah Fusarium sp. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kemampuan empat pasangan primer spesifik, yaitu FgV1, FcPV1, FcMV1, dan FcMOV1, dalam mendeteksi target mycovirus pada isolat Fusarium sp. dari berbagai asal. Penelitian dilaksanakan secara deskriptif eksploratif dengan pendekatan molekuler di Center for Development of Advanced Sciences and Technology (CDAST), Universitas Jember, pada Oktober 2025 hingga Agustus 2026. Penelitian menggunakan 11 isolat Fusarium sp. yang berasal dari berbagai komoditas tanaman dan lokasi. Tahapan penelitian meliputi isolasi RNA total, perlakuan enzimatik menggunakan S1 nuclease untuk pengayaan dsRNA, sintesis complementary DNA (cDNA), amplifikasi menggunakan metode RT-PCR dengan empat pasangan primer spesifik yang diuji secara terpisah, serta analisis produk amplifikasi melalui elektroforesis gel agarosa 2%. Hasil isolasi menunjukkan bahwa konsentrasi RNA total berkisar antara 119,76–1.265,00 ng/µL, dengan rasio A260/A280 sebesar 1,997–2,212 dan A260/A230 sebesar 0,884–2,440. Hasil elektroforesis menunjukkan bahwa tidak ditemukan pita DNA pada ukuran target yang diharapkan pada seluruh 11 isolat untuk keempat pasangan primer yang digunakan. Dengan demikian, target mycovirus yang diperiksa belum terdeteksi pada kondisi RT-PCR yang diterapkan. Hasil tersebut tidak dapat digunakan untuk menyimpulkan bahwa seluruh isolat bebas dari mycovirus karena deteksi terbatas pada empat target yang diuji. Penelitian lanjutan diperlukan dengan menggunakan kontrol positif, evaluasi kondisi RT-PCR, dan pasangan primer tambahan untuk memperluas cakupan deteksi mycovirus pada Fusarium sp.


Deskripsi Lain

Mycoviruses are viruses that infect fungi and have the potential to influence the biological characteristics of their hosts, including virulence. One type of fungus that can serve a host for mycoviruses is Fusarium sp. This study aims to determine the ability of four specific primer pairs—FgV1, FcPV1, FcMV1, and FcMOV1—to detect mycovirus targets in Fusarium sp. isolates from various sources. The study was conducted a descriptive-exploratory study using a molecular approach at the Center for Development of Advanced Sciences and Technology (CDAST), University of Jember, from October 2025 to August 2026. The study utilized 11 Fusarium sp. isolates sourced from various crop commodities and locations. The research stages included total RNA isolation, enzymatic treatment using S1 nuclease for dsRNA enrichment, complementary DNA (cDNA) synthesis, amplification using the RT-PCR method with four specific primer pairs tested separately, and analysis of the amplification products via 2% agarose gel electrophoresis. The isolation results showed that total RNA concentrations ranged from 119.76 to 1,265.00 ng/µL, with A260/A280 ratios of 1.997–2.212 and A260/A230 ratios of 0.884–2.440. The electrophoresis results showed that no DNA bands at the expected target sizes were detected in any of the 11 isolates for all four primer pairs used. Thus, the mycovirus targets examined were not detected under the RT-PCR conditions applied. These results cannot be used to conclude that all isolates are free of mycoviruses because detection was limited to the four targets tested. Further research is needed using positive controls, evaluation of RT-PCR conditions, and additional primer pairs to expand the scope of mycovirus detection in Fusarium sp.

• Pengaruh Pemberian Asap Cair Tempurung Kelapa Terhadap Pertumbuhan Cendawan Fusarium (Fusarium Sp.) Secara In Vitro.
• PENGARUH EKSTRAK DAUN DAN KULIT BATANG GAMAL (Gliricidia sepium) TERHADAP FUSARIUM SP. SECARA IN VITRO
• PENGARUH BAKTERI ANTAGONIS PSEUDOMONAD PENDARFLUOR TERHADAP PERTUMBUHAN CENDAWAN PATOGEN Fusarium sp
• Identifikasi Mycovirus pada Isolat Fusarium Sp. dari Berbagai Asal Menggunakan Beberapa Jenis Primer Spesifik
• Pengujian Keberadaan Mycovirus pada Isolat Fusarium sp. dengan Morfologi Visual, Spot Assay, dan Pendekatan Molekuler